RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	GAL11	P19659	1081 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	TOM20	P35180	183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	SPR3	P41901	512 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	UBX5	Q06682	500 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	BIO2	P32451	375 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	OCA5	P38738	679 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	LSB6	P42951	607 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	TLG1	Q03322	224 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
YPT53	YNL093W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	PRY1	P47032	299 aa		5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	YNL165W	P53891	406 aa		5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	TFB3	Q03290	321 aa		5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	PLP2	Q12017	286 aa		5	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	RAD2	P07276	1031 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	HPC2	Q01448	625 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	SWI5	P08153	709 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	HEM3	P28789	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	MSC7	P38694	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	ALD2	P47771	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	YNL108C	P53929	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	ERP2	P39704	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPT53	YNL093W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	MET1	P36150	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	TSR4	P25040	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	TAT1	P38085	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	DAL5	P15365	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	ATG3	P40344	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	TPM2	P40414	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	HOS4	P40480	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	NNF1	P47149	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	MEH1	Q02205	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	TAF13	P11747	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	YPP1	P46951	817 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RNH70	P53331	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RGP1	P16664	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	SEC20	P28791	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	BLI1	P35727	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	IES1	P43579	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RIM21	P48565	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	MLF3	P32047	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	PPG1	P32838	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YPT53	YNL093W	NTH2	P35172	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	YGL081W	P53156	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ENT2	Q05785	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	KAR1	P11927	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	OPI1	P21957	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	MAC1	P35192	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	BUD9	P53226	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ENV11	P53246	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	MCM1	P11746	286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	PRK1	P40494	810 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	COG4	Q06096	861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPT53	YNL093W	ERP4	Q12450	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.8 ms