RNA–Protein interactions for RNA: YJL037W

IRC18, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene IRC18, Length 675 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC18	YJL037W	YOR1	P53049	1477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	YAF9	P53930	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	HED1	Q03937	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	FRT1	Q99332	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MET4	P32389	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MET1	P36150	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MLP2	P40457	1679 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	SPR3	P41901	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	CWH41	P53008	833 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	KXD1	P53158	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
IRC18	YJL037W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	PAN1	P32521	1480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	RRN7	P40992	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MNL2	Q12205	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MIP1	P15801	1254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	FAR11	P53917	953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	UBP1	P25037	809 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	VAC17	P25591	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	IXR1	P33417	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	NTH2	P35172	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	RMD1	Q03441	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IRC18	YJL037W	SUV3	P32580	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	MAD1	P40957	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	HXT10	P43581	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	HDA3	Q06623	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	MET32	Q12041	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	VTH1	P40438	1549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	VTH2	P40890	1549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	MOD5	P07884	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	CLN2	P20438	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	TPD3	P31383	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	VAC8	P39968	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	FYV10	P40492	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RNH70	P53331	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	CYT1	P07143	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	AFT1	P22149	690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	OSW7	P43611	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ALD3	P54114	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	UFD2	P54860	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ATG20	Q07528	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	MYO4	P32492	1471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	MCM2	P29469	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	PPG1	P32838	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ASH1	P34233	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	YBR197C	P38306	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	YJL049W	P47048	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	VPS16	Q03308	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	PIN2	Q12057	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	SPP41	P38904	1435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	TOP1	P04786	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ISC10	P32645	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	VPS35	P34110	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	APC11	Q12157	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	PEP7	P32609	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	RTT106	P40161	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	DAK2	P43550	591 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	SPR28	Q04921	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	MET5	P47169	1442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	SWI5	P08153	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	YNL011C	P53980	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IRC18	YJL037W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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