RNA–Protein interactions for RNA: YHR015W

MIP6, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene MIP6, Length 1,980 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIP6	YHR015W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	MOD5	P07884	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	TPD3	P31383	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	PET112	P33893	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	RTT106	P40161	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	HXT5	P38695	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	OSW7	P43611	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	YJL049W	P47048	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	HUL5	P53119	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	APP1	P53933	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	YNL011C	P53980	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	CDC55	Q00362	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	RAD2	P07276	1031 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	SWE1	P32944	819 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	VPS35	P34110	944 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	CWC24	P53769	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	GRX4	P32642	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	PPM2	Q08282	695 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIP6	YHR015W	MNR2	P35724	969 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YJR142W	P47173	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	MRPL33	P20084	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	PRI2	P20457	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	AMS1	P22855	1083 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	UTR2	P32623	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	MNN1	P39106	762 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SAM37	P50110	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SRC1	Q03707	834 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	TIM23	P32897	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YKL069W	P36088	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	NUP82	P40368	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	RSC4	Q02206	625 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	ISU1	Q03020	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	OXR1	Q08952	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	RAD4	P14736	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	DUT1	P33317	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	UGA4	P32837	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	BSC2	Q05611	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	VMA3	P25515	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YHL008C	P38750	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	BDP1	P46678	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	CLA4	P48562	842 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	DAL4	Q04895	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	CDC34	P14682	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	FBP26	P32604	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	HXT8	P40886	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
MIP6	YHR015W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	RGD2	P43556	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YGR053C	P53234	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	PUS5	Q06244	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	OPI10	Q08202	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	WTM2	Q12206	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	KIP2	P28743	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	SMC1	P32908	1225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	TIM54	P47045	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MIP6	YHR015W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	UBP12	P39538	1254 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	TYW3	P53177	273 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	YNL165W	P53891	406 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	PHO8	P11491	566 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	MKS1	P34072	584 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	RAD55	P38953	406 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	MRPS18	P42847	217 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	CCP1	P00431	361 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	MCM1	P11746	286 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	STE6	P12866	1290 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	MSN1	P22148	382 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIP6	YHR015W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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