RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 TONSLQ96HA7 1378 aa9.74□□□□□ -0.85
PCAT5-201ENST00000626667 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PCAT5-201ENST00000626667 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PCAT5-201ENST00000626667 PIK3C2AO00443 1686 aa9.72□□□□□ -0.85
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.72□□□□□ -0.85
PCAT5-201ENST00000626667 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.71□□□□□ -0.85
PCAT5-201ENST00000626667 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 NWD1Q149M9 1564 aa9.7□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 GLI3P10071 1580 aa9.68□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 MST1RQ04912 1400 aa9.68□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.66□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.65□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 SSH2Q76I76 1423 aa9.65□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.65□□□□□ -0.86
PCAT5-201ENST00000626667 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.65□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 ABCC6O95255 1503 aa9.65□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CREBZFQ9NS37 354 aa9.64□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.64□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.63□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 ZMYM3Q14202 1370 aa9.61□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CD109Q6YHK3 1445 aa9.61□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 NCAPD2Q15021 1401 aa9.61□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 PRR29P0C7W0 189 aa9.61□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 PKD2Q13563 968 aa9.61□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.61□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.6□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 PAPPAQ13219 1627 aa9.6□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 COL18A1P39060 1754 aa9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 ALS2Q96Q42 1657 aa9.59□□□□□ -0.87
PCAT5-201ENST00000626667 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.58□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.58□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 ATP7BP35670 1465 aa9.58□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 CACNA1FO60840 1977 aa9.57□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 ABCA3Q99758 1704 aa9.57□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.56□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.56□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.55□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.54□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.54□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.53□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 ABCC11Q96J66 1382 aa9.52□□□□□ -0.88
PCAT5-201ENST00000626667 LTN1O94822 1766 aa9.52□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.52□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.52□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.52□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.51□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.5□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.5□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 RALBP1Q15311 655 aa9.5□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 TSPOAP1O95153 1857 aa9.5□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NSD2O96028 1365 aa9.5□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.49□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 PLEKHG5O94827 1062 aa9.49□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.49□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NFAT5O94916 1531 aa9.48□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 SPOCK2Q92563 424 aa9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 PIK3R4Q99570 1358 aa9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 NUBP1P53384 320 aa9.47□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 PTCH1Q13635 1447 aa9.46□□□□□ -0.89
PCAT5-201ENST00000626667 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
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