RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623691.3

GPS1-226, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene GPS1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-226ENST00000623691 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.73■■□□□ 1.23
GPS1-226ENST00000623691 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.72■■□□□ 1.23
GPS1-226ENST00000623691 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GPS1-226ENST00000623691 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.71■■□□□ 1.23
GPS1-226ENST00000623691 STK26Q9P289 416 aa22.7■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 FKBP8Q14318 412 aa22.69■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 PPP2R1AP30153 589 aa22.68■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.66■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 EVC2Q86UK5 1308 aa22.66■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.65■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.64■■□□□ 1.22
GPS1-226ENST00000623691 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.64■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 DLC1Q96QB1 1528 aa22.63■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 NEFLP07196 543 aa22.63■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 DIP2AQ14689 1571 aa22.63■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 METP08581 1390 aa22.62■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 USP32Q8NFA0 1604 aa22.61■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 PRAM1Q96QH2 718 aa22.61■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.61■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 CABP2Q9NPB3 220 aa22.59■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.59■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 MED14O60244 1454 aa22.59■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.58■■□□□ 1.21
GPS1-226ENST00000623691 ABCC11Q96J66 1382 aa22.58■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.57■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 HSPA2P54652 639 aa22.57■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 POGKQ9P215 609 aa22.57■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.56■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 NUDCQ9Y266 331 aa22.56■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.55■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 TBX22Q9Y458 520 aa22.54■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.52■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 CPS1P31327 1500 aa22.52■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.52■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GPS1-226ENST00000623691 TECPR2O15040 1411 aa22.51■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.5■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 PTPRUQ92729 1446 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 SIRT1Q96EB6 747 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.49■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 PDE3BQ13370 1112 aa22.48■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 STRCQ7RTU9 1775 aa22.48■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 A0A1W2PP64 1363 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 NSD2O96028 1365 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 CDK19Q9BWU1 502 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.47■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 MORC1Q86VD1 984 aa22.46■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 PIK3R4Q99570 1358 aa22.46■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.46■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.45■■□□□ 1.19
GPS1-226ENST00000623691 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.43■■□□□ 1.18
GPS1-226ENST00000623691 PTCH1Q13635 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
GPS1-226ENST00000623691 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GPS1-226ENST00000623691 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.39■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 ZNF521Q96K83 1311 aa22.39■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 KCNA6P17658 529 aa22.38■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 SHPRHQ149N8 1683 aa22.38■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 CABP1Q9NZU7 370 aa22.38■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 NWD1Q149M9 1564 aa22.37■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.37■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 ATP7BP35670 1465 aa22.36■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.35■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 FYB1O15117 783 aa22.34■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 ADGRB2O60241 1585 aa22.33■■□□□ 1.17
GPS1-226ENST00000623691 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.33■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 MTHFSP49914 203 aa22.32■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.32■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.31■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.3■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.29■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 NGEFQ8N5V2 710 aa22.28■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.27■■□□□ 1.16
GPS1-226ENST00000623691 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.27■■□□□ 1.15
GPS1-226ENST00000623691 APAF1O14727 1248 aa22.27■■□□□ 1.15
GPS1-226ENST00000623691 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.27■■□□□ 1.15
GPS1-226ENST00000623691 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GPS1-226ENST00000623691 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GPS1-226ENST00000623691 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms