RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 PRAM1Q96QH2 718 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.59■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 BECN2A8MW95 431 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC27Q2M243 656 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 TPM1P09493 284 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC7Q96M83 1385 aa24.58■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.58■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 PDE4AP27815 886 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 WASHC4Q2M389 1173 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 KIF21BO75037 1637 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 MTHFSP49914 203 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 FYB1O15117 783 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 FAM177BA6PVY3 158 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDP1-208ENST00000613122 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 WWC1Q8IX03 1113 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 NESP48681 1621 aa24.5■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 HFM1A2PYH4 1435 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 CDK19Q9BWU1 502 aa24.48■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 PRKAR2BP31323 418 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 LNPKQ9C0E8 428 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 GNAI3P08754 354 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 CFTRP13569 1480 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 BICD2Q8TD16 824 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.45■■□□□ 1.51
CTDP1-208ENST00000613122 AAMPQ13685 434 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 CABP4P57796 275 aa24.45■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 RAPGEF3O95398 923 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 SLC4A3P48751 1232 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 ARID3AQ99856 593 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 FSD1Q9BTV5 496 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 SPG7Q9UQ90 795 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 CNTROBQ8N137 903 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 PANK1Q8TE04 598 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 CABP1Q9NZU7 370 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 FOSBP53539 338 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 PIP4K2BP78356 416 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 MTMR7Q9Y216 660 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R1AP30153 589 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDP1-208ENST00000613122 XBP1P17861 261 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-208ENST00000613122 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
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