RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601417.1

ERVV-2-201, Transcript of endogenous retrovirus group V member 2, envelope, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene ERVV-2, Length 2,431 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2-201ENST00000601417 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 MS4A1P11836 297 aa12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 MNS1Q8NEH6 495 aa12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 CCDC189A1A4V9 331 aa12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 KLHL33A6NCF5 533 aa12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 MED4Q9NPJ6 270 aa12.17□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.17□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 GOLGA6CA6NDK9 693 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 GOLGA6BA6NDN3 693 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 COQ9O75208 318 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 GOLGA6DP0CG33 693 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 CEP170Q5SW79 1584 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 IQGAP2Q13576 1575 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 ICE2Q659A1 982 aa12.16□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 GUCY2CP25092 1073 aa12.15□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.15□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.15□□□□□ -0.46
ERVV-2-201ENST00000601417 KIF3CO14782 793 aa12.15□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 ATP2B3Q16720 1220 aa12.15□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.15□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 NME8Q8N427 588 aa12.14□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 LRCH2Q5VUJ6 765 aa12.13□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.13□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.13□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CEP162Q5TB80 1403 aa12.13□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 PIK3R5Q8WYR1 880 aa12.13□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 UVSSAQ2YD98 709 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 C11orf91Q3C1V1 193 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CTAGE5O15320 804 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 BRD1O95696 1058 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 JMYQ8N9B5 988 aa12.12□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 BIRC2Q13490 618 aa12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SAMD9Q5K651 1589 aa12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 RAD50Q92878 1312 aa12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.11□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SUFUQ9UMX1 484 aa12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SSFA2P28290 1259 aa12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 ANAPC4Q9UJX5 808 aa12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 SHROOM2Q13796 1616 aa12.1□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CLIP1P30622 1438 aa12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 LIG1P18858 919 aa12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 RSPH14Q9UHP6 348 aa12.09□□□□□ -0.47
ERVV-2-201ENST00000601417 ATL2Q8NHH9 583 aa12.08□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 KNSTRNQ9Y448 316 aa12.08□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 PAX7P23759 505 aa12.08□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 MTA3Q9BTC8 594 aa12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 CXorf56Q9H5V9 222 aa12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.06□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 SLC4A3P48751 1232 aa12.05□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 SLFN14P0C7P3 912 aa12.05□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 TNNT1P13805 278 aa12.05□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 KIAA0556O60303 1618 aa12.04□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 TPM3P06753 285 aa12.04□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 FEZ1Q99689 392 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 ANP32CO43423 234 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 TRDNQ13061 729 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 BECN1Q14457 450 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 CCDC125Q86Z20 511 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 ARAP1Q96P48 1450 aa12.03□□□□□ -0.48
ERVV-2-201ENST00000601417 HS1BP3Q53T59 392 aa12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms