RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP99D6REC4 459 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 PSEN2P49810 448 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 RFX1P22670 979 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.82□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 BRD1O95696 1058 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF428Q96B54 188 aa6.81□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNA1Q09470 495 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR2Q13614 643 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 USTQ9Y2C2 406 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 NACADO15069 1562 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 SNPHO15079 494 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 FUT2Q10981 343 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG2Q9H553 416 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 CARNS1A5YM72 827 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 WASHC4Q2M389 1173 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-210ENST00000590211 SCRIBQ14160 1630 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP33O14559 1287 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 VAC14Q08AM6 782 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 UCN2Q96RP3 112 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCC9O60706 1549 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 OTUD5Q96G74 571 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 CFHP08603 1231 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR7Q8TB68 274 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V1AP38606 617 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf229H3BNL8 230 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 NR6A1Q15406 480 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 MORN1Q5T089 497 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 SLF2Q8IX21 1173 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNH8Q96L42 1107 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-210ENST00000590211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 E9PSI1 815 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 CDCA8Q53HL2 280 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 DESI1Q6ICB0 168 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 RETREG3Q86VR2 466 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 TSC1Q92574 1164 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG7O95352 703 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 PBX2P40425 430 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC27Q2M243 656 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 LYPD8Q6UX82 237 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 ERBB3P21860 1342 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEB3A0JP26 581 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 IGSF3O75054 1194 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX11P35716 441 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEBQ6S5H4 581 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.347e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-210ENST00000590211 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 TK2O00142 265 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 ST18O60284 1047 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 HRO43593 1189 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 SEMA3FQ13275 785 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 BRICD5Q6PL45 260 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-210ENST00000590211 THAP11Q96EK4 314 aa6.66□□□□□ -1.34
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