RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 RCCD1A6NED2 376 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 RNF40O75150 1001 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 SLF2Q8IX21 1173 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC2Q92887 1545 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 DISP1Q96F81 1524 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 SAMD9Q5K651 1589 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 SLC4A3P48751 1232 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 PPP4CP60510 307 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 NECTIN2Q92692 538 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC102AQ96A19 550 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 PHOX2BQ99453 314 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-204ENST00000558666 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.15□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 DIP2BQ9P265 1576 aa7.15□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 IRF6O14896 467 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP7Q8WX94 980 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 PRXQ9BXM0 1461 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 ZMYND10O75800 440 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 APLP1P51693 650 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 BARGINQ6ZT62 677 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 ARID3CA6NKF2 412 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 CFHP08603 1231 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 SLC10A3P09131 477 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 EEA1Q15075 1411 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA8O94911 1581 aa7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 IFFO2Q5TF58 517 aa7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 PRR14Q9BWN1 585 aa7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 GOLGA3Q08378 1498 aa7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-204ENST00000558666 MAPKBP1O60336 1514 aa7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 PTPRGP23470 1445 aa7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 KDM6BO15054 1643 aa7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 SULF1Q8IWU6 871 aa7.07□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 MTRQ99707 1265 aa7.07□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 HECW1Q76N89 1606 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 CLCN1P35523 988 aa7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 KCNC4Q03721 635 aa7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 RDH13Q8NBN7 331 aa7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 UACAQ9BZF9 1416 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 AMHR2Q16671 573 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 IL21Q9HBE4 155 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 KIF14Q15058 1648 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 ASXL2Q76L83 1435 aa7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0G2JS52 829 aa7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 COPS2P61201 443 aa7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-204ENST00000558666 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 CD46P15529 392 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 GCGRP47871 477 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF516Q92618 1163 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 AK7Q96M32 723 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM66O15016 1216 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 PARP9Q8IXQ6 854 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 SLC24A3Q9HC58 644 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 TLL1O43897 1013 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ZPR1O75312 459 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms