RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553417.1

PRMT5-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-208	ENST00000553417	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	LAMC1	P11047	1609 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	ORAI2	Q96SN7	254 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	ADGRB2	O60241	1585 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	SLIT2	O94813	1529 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	VPS72	Q15906	364 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRMT5-208	ENST00000553417	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	KCNQ2	O43526	872 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	USP32	Q8NFA0	1604 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PXDN	Q92626	1479 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MET	P08581	1390 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FOXO3	O43524	673 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TRIM37	O94972	964 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	APBA3	O96018	575 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PRMT5-208	ENST00000553417	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	ABCC5	O15440	1437 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	CHD4	Q14839	1912 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	CAPN15	O75808	1086 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	DAPK1	P53355	1430 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	RREB1	Q92766	1687 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRMT5-208	ENST00000553417	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	NUTM2F	A1L443	756 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	UTRN	P46939	3433 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	MYOM1	P52179	1685 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	DLC1	Q96QB1	1528 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	PSME1	Q06323	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	GPR162	Q16538	588 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417		E9PCH4	1651 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT5-208	ENST00000553417	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	HSPA6	P17066	643 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	ABCA3	Q99758	1704 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	NAIP	Q13075	1403 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	PTGER2	P43116	358 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC34A2	O95436	690 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRMT5-208	ENST00000553417	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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