RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TOMM22Q9NS69 142 aa10.36□□□□□ -0.75
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PTPRB-208ENST00000550358 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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PTPRB-208ENST00000550358 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.31□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.3□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.29□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 VPS53Q5VIR6 699 aa10.29□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 ABCC11Q96J66 1382 aa10.29□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 NUTM2FA1L443 756 aa10.28□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-208ENST00000550358 PPP2R1AP30153 589 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-208ENST00000550358 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-208ENST00000550358 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-208ENST00000550358 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.28□□□□□ -0.76
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PTPRB-208ENST00000550358 ADGRL1O94910 1474 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 ABTB2Q8N961 1025 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 COG6Q9Y2V7 657 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 AFAP1Q8N556 730 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 CABP2Q9NPB3 220 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
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