RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K9	P80192	1104 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	SEMA3E	O15041	775 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP155	O75694	1391 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP160	Q12769	1436 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCA8	O94911	1581 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A1	P11836	297 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE3B	Q13370	1112 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TMC1	Q8TDI8	760 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	SYNJ2	O15056	1496 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC34A2	O95436	690 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2R1	Q13018	1463 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	NLRP13	Q86W25	1043 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	OXER1	Q8TDS5	423 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMC1	P11047	1609 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP10B	O94823	1461 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D12	O60347	775 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PDIA6	Q15084	440 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	BACH2	Q9BYV9	841 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	TESK2	Q96S53	571 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP10A	O60312	1499 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	A2M	P01023	1474 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC13B	O14795	1591 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		6.59	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	EVI5	O60447	810 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	DOK7	Q18PE1	504 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	JPH4	Q96JJ6	628 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	USP35	Q9P2H5	1018 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	RIMBP2	O15034	1052 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPY4	P0CV99	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPY10	P0CW01	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	PTGER2	P43116	358 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	PREX2	Q70Z35	1606 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF521	Q96K83	1311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	SNPH	O15079	494 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ATXN3-212	ENST00000515746	CRBN	Q96SW2	442 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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