RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 RCCD1A6NED2 376 aa8.54□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJB2P25686 324 aa8.54□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.54□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHD1O14646 1710 aa8.54□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC10A3P09131 477 aa8.53□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.53□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 IQGAP2Q13576 1575 aa8.52□□□□□ -1.04
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOCS7O14512 581 aa8.52□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.52□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.52□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF223E7ERA6 249 aa8.51□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 LAPTM4AQ15012 233 aa8.51□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.51□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUP160Q12769 1436 aa8.5□□□□□ -1.05
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP170Q5SW79 1584 aa8.49□□□□□ -1.05
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ARHGEF3-215ENST00000498517 FECHP22830 423 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR37O15354 613 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 FCHSD2O94868 740 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 S1PR4O95977 384 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.46□□□□□ -1.05
ARHGEF3-215ENST00000498517 FMN1Q68DA7 1419 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 GGCXP38435 758 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC4A3P48751 1232 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP7Q8WX94 980 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR14Q9BWN1 585 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARAP1Q96P48 1450 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC19A1P41440 591 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 SAMD9Q5K651 1589 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO41Q8TF61 875 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHOX2BQ99453 314 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPRGP23470 1445 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.42□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 DISP1Q96F81 1524 aa8.41□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIC1Q14526 733 aa8.41□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPRYD7Q5W111 196 aa8.41□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA0556O60303 1618 aa8.4□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.4□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADH1BP00325 375 aa8.4□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.4□□□□□ -1.06
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLCB2Q00722 1185 aa8.39□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.39□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHROOM2Q13796 1616 aa8.39□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.38□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNPATO15228 680 aa8.38□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 OATP04181 439 aa8.38□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.37□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.36□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARID3CA6NKF2 412 aa8.36□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNFRSF10AO00220 468 aa8.36□□□□□ -1.07
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NR1I2O75469 434 aa8.36□□□□□ -1.07
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.36□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.35□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 THAP11Q96EK4 314 aa8.35□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 HECW1Q76N89 1606 aa8.34□□□□□ -1.07
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ARHGEF3-215ENST00000498517 POTECB2RU33 542 aa8.34□□□□□ -1.07
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR20AP86496 221 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYT1Q01538 1121 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 FUT2Q10981 343 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 MORN1Q5T089 497 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF787Q6DD87 383 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 UACAQ9BZF9 1416 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.34□□□□□ -1.07
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGEF11O15085 1522 aa8.34□□□□□ -1.08
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.33□□□□□ -1.08
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