RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-212ENST00000477970 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-212ENST00000477970 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF521Q96K83 1311 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-212ENST00000477970 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-212ENST00000477970 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-212ENST00000477970 MED14O60244 1454 aa16.23■□□□□ 0.19
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PTPRF-212ENST00000477970 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-212ENST00000477970 WDR63Q8IWG1 891 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-212ENST00000477970 MTHFSP49914 203 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-212ENST00000477970 WWC1Q8IX03 1113 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-212ENST00000477970 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRF-212ENST00000477970 POGKQ9P215 609 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRF-212ENST00000477970 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.96■□□□□ 0.15
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