RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ABL2P42684 1182 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SLF2Q8IX21 1173 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 MTMR2Q13614 643 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 GUCA2AQ02747 115 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HLA-CQ95604 372 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 STAC3Q96MF2 364 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CFHP08603 1231 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 NBPF3Q9H094 633 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HCSTQ9UBK5 93 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-207ENST00000470201 FUT2Q10981 343 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GLMNQ92990 594 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 POM121CA8CG34 1229 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP99D6REC4 459 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf229H3BNL8 230 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP6V1AP38606 617 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 WASHC4Q2M389 1173 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 NECTIN2Q92692 538 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF40O75150 1001 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 IRF5Q13568 498 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TSC1Q92574 1164 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR37L1O60883 481 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 RETREG3Q86VR2 466 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR7Q8TB68 274 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 MORN1Q5T089 497 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 LRCH3Q96II8 777 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR14Q9BWN1 585 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 Q3C1V9 767 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 DESI1Q6ICB0 168 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 RETREG2Q8NC44 543 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN5P54829 565 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 VAC14Q08AM6 782 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX11P35716 441 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 NR6A1Q15406 480 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PNMA1Q8ND90 353 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT2BQ93097 391 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-207ENST00000470201 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 ALG2Q9H553 416 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE4CQ08493 712 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 LYPD8Q6UX82 237 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP4CP60510 307 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMA3FQ13275 785 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 BRICD5Q6PL45 260 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 UCN2Q96RP3 112 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-207ENST00000470201 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 RFX1P22670 979 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 APLP1P51693 650 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 NR1H3Q13133 447 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.27□□□□□ -1.09
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