RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.6□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.6□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.6□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CFAP44Q96MT7 982 aa7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP10BO94823 1461 aa7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.59□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.58□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.58□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPRGP23470 1445 aa7.58□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.58□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SHROOM2Q13796 1616 aa7.57□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.57□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.57□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.57□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF14Q15058 1648 aa7.56□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K9P80192 1104 aa7.56□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDE4AP27815 886 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.55□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.54□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLCB2Q00722 1185 aa7.54□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF787Q6DD87 383 aa7.54□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXW7Q969H0 707 aa7.54□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRCH3Q96II8 777 aa7.54□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.54□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHF14O94880 888 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPY4P0CV99 314 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPY10P0CW01 314 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM52Q96A61 297 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PZPP20742 1482 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MBD5Q9P267 1494 aa7.53□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.52□□□□□ -1.2
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANP32CO43423 234 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC2Q92887 1545 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.51□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.51□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.51□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM6BO15054 1643 aa7.51□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.5□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MFSD10Q14728 455 aa7.5□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.49□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.49□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PREX2Q70Z35 1606 aa7.49□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.48□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP10AO60312 1499 aa7.48□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF15Q9NS87 1388 aa7.47□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.47□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLCH2O75038 1416 aa7.47□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MTRQ99707 1265 aa7.47□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.47□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLXNC1O60486 1568 aa7.46□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERBINQ96RT1 1412 aa7.46□□□□□ -1.21
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSKSQ9UJT2 592 aa7.46□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.46□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUP155O75694 1391 aa7.46□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP4CP60510 307 aa7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF516Q92618 1163 aa7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC7Q96M83 1385 aa7.45□□□□□ -1.22
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHD1O14646 1710 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms