RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CASC1Q6TDU7 716 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MYBPC2Q14324 1141 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 RHBDL3P58872 404 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 ERBB3P21860 1342 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF3Q5VWG9 929 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 CCER2I3L3R5 266 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN15O75808 1086 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 TNNT1P13805 278 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 NFKBIBQ15653 356 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF4Q96M43 638 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP83Q9Y592 693 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP10BO94823 1461 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 HECW1Q76N89 1606 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MTA1Q13330 715 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 RAI14Q9P0K7 980 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP7D2Q96T17 732 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-202ENST00000380828 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM5CP41229 1560 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 ERBB4Q15303 1308 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC125Q86Z20 511 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC172P0C7W6 258 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 PREX2Q70Z35 1606 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 APBB1O00213 710 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX14O75381 377 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 MTA3Q9BTC8 594 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 MROH2AA6NES4 1674 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH6O60337 910 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 CBX1P83916 185 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM212AQ96EL1 285 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-202ENST00000380828 BIRC2Q13490 618 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF280DQ6N043 979 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PAX3P23760 479 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 TDO2P48775 406 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PPME1Q9Y570 386 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 ITFG2Q969R8 447 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF4AO95239 1232 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 FMN1Q68DA7 1419 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 CD109Q6YHK3 1445 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PPFIA4O75335 1185 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 AGLP35573 1532 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC189A1A4V9 331 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PANK2Q9BZ23 570 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMA2Q9UL42 364 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF14Q15058 1648 aa8.5□□□□□ -1.05
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