RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFAP99D6REC4 459 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAD21O60216 631 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR37L1O60883 481 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTDSPL2Q05D32 466 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNH8Q96L42 1107 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 BANK1Q8NDB2 785 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 HRO43593 1189 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRF5Q13568 498 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFFO2Q5TF58 517 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM34Q9BYJ4 488 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 C6orf229H3BNL8 230 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCAMP50895 628 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 STAC3Q96MF2 364 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP46P62068 366 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTMR2Q13614 643 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 GJA5P36382 358 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 VAC14Q08AM6 782 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLF2Q8IX21 1173 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLMNQ92990 594 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 APLP1P51693 650 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 NR6A1Q15406 480 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 MORN1Q5T089 497 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR7Q8TB68 274 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 NBPF3Q9H094 633 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP6V1AP38606 617 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRCH3Q96II8 777 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0G2JS52 829 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPN5P54829 565 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 NECTIN2Q92692 538 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 CARNS1A5YM72 827 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFX1P22670 979 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRDM9Q9NQV7 894 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLL1O43897 1013 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 RETREG2Q8NC44 543 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP10Q9P2G4 905 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 COPS2P61201 443 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDCA8Q53HL2 280 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 RETREG3Q86VR2 466 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 UCN2Q96RP3 112 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 WBP1LQ9NX94 342 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A3P48751 1232 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 WNT2BQ93097 391 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 THAP11Q96EK4 314 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOCS7O14512 581 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP4CP60510 307 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 BRICD5Q6PL45 260 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZNB5 142 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIK3CDO00329 1044 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYPD8Q6UX82 237 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 WWC1Q8IX03 1113 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALG2Q9H553 416 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO45P0C2W1 286 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms