RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 POM121CA8CG34 1229 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 TK2O00142 265 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRF5Q13568 498 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 LHX8Q68G74 356 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 MARVELD3Q96A59 401 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 POTEB3A0JP26 581 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM205CA6NFA0 338 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 C6orf229H3BNL8 230 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP6V1AP38606 617 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 POTEBQ6S5H4 581 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 GLMNQ92990 594 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF40O75150 1001 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 MORN1Q5T089 497 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 WASHC4Q2M389 1173 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 RETREG3Q86VR2 466 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRR7Q8TB68 274 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSC1Q92574 1164 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 NECTIN2Q92692 538 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRCH3Q96II8 777 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 HRO43593 1189 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-655P-201ENST00000362858 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q3C1V9 767 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 DESI1Q6ICB0 168 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRR14Q9BWN1 585 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 VAC14Q08AM6 782 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR6A1Q15406 480 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 LYPD8Q6UX82 237 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 APLP1P51693 650 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 RETREG2Q8NC44 543 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALG2Q9H553 416 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOX11P35716 441 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCAMP50895 628 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP4CP60510 307 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 BRICD5Q6PL45 260 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 THAP11Q96EK4 314 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 UCN2Q96RP3 112 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR1I2O75469 434 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 JUNDP17535 347 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PNMA1Q8ND90 353 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 WNT2BQ93097 391 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBXO45P0C2W1 286 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR1H3Q13133 447 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPRNQ16849 979 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSS51Q4VC12 460 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 STAC3Q96MF2 364 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFX1P22670 979 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEMA3FQ13275 785 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 WBP1LQ9NX94 342 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAP10Q9P2G4 905 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-655P-201ENST00000362858 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms