RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-201ENST00000356100 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-201ENST00000356100 MCTP1Q6DN14 999 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-201ENST00000356100 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-201ENST00000356100 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-201ENST00000356100 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-201ENST00000356100 KIF14Q15058 1648 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 PDE4AP27815 886 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 MBD3O95983 291 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CDC45O75419 566 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 PSME1Q06323 249 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CFTRP13569 1480 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 DCTN1Q14203 1278 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RIPK4P57078 832 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF428Q96B54 188 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RUFY1Q96T51 708 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 GNAI3P08754 354 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CNTROBQ8N137 903 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ATF3P18847 181 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ARID3AQ99856 593 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 IQGAP2Q13576 1575 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 BICD2Q8TD16 824 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 IGF1RP08069 1367 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 MAP7D2Q96T17 732 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 APPP05067 770 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 EPS15P42566 896 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 OLFM4Q6UX06 510 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 JMYQ8N9B5 988 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 SYNJ1O43426 1573 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RABEP1Q15276 862 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 TXLNAP40222 546 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 IL27Q8NEV9 243 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD1Q15327 319 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 HOMER1Q86YM7 354 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 GCC1Q96CN9 775 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K1Q13233 1512 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 ODF2Q5BJF6 829 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 PDE3AQ14432 1141 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 COG6Q9Y2V7 657 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-201ENST00000356100 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms