RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.65■■□□□ 1.7
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PPP1CC-201ENST00000335007 WDR63Q8IWG1 891 aa25.64■■□□□ 1.69
PPP1CC-201ENST00000335007 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PPP1CC-201ENST00000335007 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRTO14522 1441 aa25.63■■□□□ 1.69
PPP1CC-201ENST00000335007 SHROOM2Q13796 1616 aa25.63■■□□□ 1.69
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PPP1CC-201ENST00000335007 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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PPP1CC-201ENST00000335007 PTMSP20962 102 aa25.48■■□□□ 1.67
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PPP1CC-201ENST00000335007 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.43■■□□□ 1.66
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PPP1CC-201ENST00000335007 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.43■■□□□ 1.66
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PPP1CC-201ENST00000335007 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.38■■□□□ 1.65
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PPP1CC-201ENST00000335007 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP1CC-201ENST00000335007 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
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PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.32■■□□□ 1.64
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PPP1CC-201ENST00000335007 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 NUCB1Q02818 461 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.31■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 NSD2O96028 1365 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP1CC-201ENST00000335007 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.3■■□□□ 1.64
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