RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Col17a1Q07563 1470 aa22.03■■□□□ 1.12
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abcc6Q9R1S7 1498 aa22.02■■□□□ 1.12
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vgll3P85442 326 aa22.01■■□□□ 1.11
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca6Q8K441 1624 aa22.01■■□□□ 1.11
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm5cP41230 1554 aa21.99■■□□□ 1.11
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Os9Q8K2C7 672 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Inpp5dQ9ES52 1191 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plch2A2AP18 1501 aa21.98■■□□□ 1.11
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fndc1E9Q043 1732 aa21.97■■□□□ 1.11
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Srcin1Q9QWI6 1250 aa21.95■■□□□ 1.1
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa21.92■■□□□ 1.1
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Uggt2E9Q4X2 1504 aa21.9■■□□□ 1.1
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gli2Q0VGT2 1544 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Depdc5P61460 1591 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam43aQ8BUP8 424 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rabep1O35551 862 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zscan10Q3URR7 782 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Iqgap3F8VQ29 1632 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Erbb4Q61527 1308 aa21.86■■□□□ 1.09
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SlkO54988 1233 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa21.85■■□□□ 1.09
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc30Q8BVF4 654 aa21.84■■□□□ 1.09
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp40Q8BWR4 1235 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TimelessQ9R1X4 1197 aa21.84■■□□□ 1.09
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf521Q6KAS7 1311 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp10aO54827 1508 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Catsper2A2ARP9 588 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dip2cE9PWR4 1557 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myo3aQ8K3H5 1613 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnnt2P50752 301 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atf7ipQ7TT18 1306 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmf1B9EKI3 1091 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gse1Q3U3C9 1213 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim26Q99PN3 545 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AglF8VPN4 1532 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 VgfQ0VGU4 617 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pank1Q8K4K6 548 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abca8aQ8K442 1620 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Neurod2Q62414 383 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.78■■□□□ 1.08
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa21.77■■□□□ 1.08
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plcb2A3KGF7 1181 aa21.76■■□□□ 1.07
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Terf2O35144 541 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa21.75■■□□□ 1.07
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cnga1P29974 684 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Usp19Q3UJD6 1360 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pola1P33609 1465 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rims1Q99NE5 1463 aa21.74■■□□□ 1.07
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mknk2Q8CDB0 459 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa21.73■■□□□ 1.07
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