RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ino80Q6ZPV2 1559 aa34,2■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc7Q80TE7 1490 aa34,19■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AglF8VPN4 1532 aa34,18■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ChgaP26339 463 aaKnown RBP34,17■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P2rx7Q9Z1M0 595 aa34,17■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IqubQ8CDK3 788 aa34,16■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ralbp1Q62172 648 aa34,15■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dip2cE9PWR4 1557 aa34,15■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP34,15■■■■□ 3,06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Skint5A7XUY5 1461 aa34,13■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc27Q3V036 639 aa34,13■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AdgbG3UZ78 1657 aa34,13■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 InsrP15208 1372 aa34,12■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP34,12■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP34,11■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RereQ80TZ9 1558 aa34,11■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa34,1■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MaddQ80U28 1577 aa34,1■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GsdmaQ9EST1 446 aa34,1■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chmp5Q9D7S9 219 aa34,09■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EspnQ9ET47 871 aa34,09■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP34,08■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc52a2Q9D8F3 450 aa34,08■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bcl11aQ9QYE3 773 aa34,08■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tspyl2Q7TQI8 677 aa34,07■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atxn3Q9CVD2 355 aa34,07■■■■□ 3,05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 KdrP35918 1367 aa34,07■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh1E0CZ22 1640 aa34,07■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stk26Q99JT2 416 aa34,07■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CenpjQ569L8 1344 aa34,07■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP34,06■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Knl1Q66JQ7 1612 aa34,05■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ift172Q6VH22 1749 aa34,04■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm156Q58A37 223 aa34,03■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP34,02■■■■□ 3,04
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zranb1Q7M760 708 aa34,01■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pank1Q8K4K6 548 aa34,01■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp1b4Q99ME6 356 aa34■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Yeats2Q3TUF7 1407 aa34■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP33,98■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Iqsec2Q5DU25 1478 aa33,96■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apaf1O88879 1249 aa33,96■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cul9Q80TT8 1865 aa33,95■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa33,95■■■■□ 3,03
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zmym3Q9JLM4 1370 aa33,93■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP33,93■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cfap65Q3V0B4 1847 aa33,93■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr3glQ8R0C0 218 aa33,92■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Iqcf3Q9D498 203 aa33,92■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Shq1Q7TMX5 569 aa33,91■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsen2Q6P7W5 460 aa33,91■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP33,91■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrl3Q80TS3 1537 aa33,9■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nkx1-2P42580 305 aa33,9■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa33,9■■■■□ 3,02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adamts7Q68SA9 1657 aa33,89■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CanxP35564 591 aaKnown RBP33,88■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc37F8VPK0 1563 aa33,88■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NudcO35685 332 aaKnown RBP33,88■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hfm1D3Z4R1 1434 aa33,88■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa0556Q8C753 1610 aa33,86■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim58Q5NCC9 485 aa33,86■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim26Q99PN3 545 aa33,86■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nrxn1Q9CS84 1514 aa33,84■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf521Q6KAS7 1311 aa33,83■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ksr2Q3UVC0 959 aa33,83■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrl1Q80TR1 1466 aa33,83■■■■□ 3,01
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep170bQ80U49 1574 aa33,8■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP33,8■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa33,79■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Qser1A2BIE1 1698 aa33,79■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa33,78■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP33,78■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rlbp1Q9Z275 317 aa33,77■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q9D9H8 365 aa33,77■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtprmP28828 1452 aa33,76■■■■□ 3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim30dE9PWL0 497 aa33,76■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa33,75■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP33,74■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dusp27Q148W8 1138 aa33,73■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gsto1O09131 240 aa33,72■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armcx1Q9CX83 456 aa33,72■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP33,71■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP33,71■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnai1Q8C0M8 701 aa33,71■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam135bQ9DAI6 1403 aa33,71■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hecw2Q6I6G8 1578 aa33,7■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa33,7■■■□□ 2,99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ak7Q9D2H2 614 aa33,69■■■□□ 2,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP33,68■■■□□ 2,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Afap1Q80YS6 731 aa33,68■■■□□ 2,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk19Q8BWD8 501 aa33,68■■■□□ 2,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NinlQ6ZQ12 1394 aa33,67■■■□□ 2,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP33,66■■■□□ 2,98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppm1gQ61074 542 aa33,63■■■□□ 2,97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ipo8Q7TMY7 1010 aa33,63■■■□□ 2,97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa33,62■■■□□ 2,97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef28P97433 1693 aa33,61■■■□□ 2,97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc183A2AJB1 534 aa33,61■■■□□ 2,97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP33,6■■■□□ 2,97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,7 ms