RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1YBL048W YOR105WQ08504 108 aa-0.56□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W YDR182W-AQ3E796 67 aa-0.56□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W VTH1P40438 1549 aa-0.58□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W VTH2P40890 1549 aa-0.58□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W YDL022C-AP0C5L6 82 aa-0.58□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa-0.58□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W SPO14P36126 1683 aa-0.59□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-0.59□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W SMC4Q12267 1418 aa-0.59□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W IRC20Q06554 1556 aa-0.59□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W SIN3P22579 1536 aa-0.59□□□□□ -2.5
RRT1YBL048W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa-0.6□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W YOR314WQ12506 109 aa-0.61□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W YBR056W-AI2HB52 66 aa-0.62□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W LSM2P38203 95 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W SIP18P50263 79 aa-0.62□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W OLI1P61829 76 aa-0.62□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa-0.62□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W YSP2Q06681 1438 aa-0.63□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W KOG1P38873 1557 aa-0.63□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W LTE1P07866 1435 aa-0.64□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W MMS22Q06164 1454 aa-0.64□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W ATP17Q06405 101 aa-0.64□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa-0.64□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W TOS6P48560 102 aa-0.65□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa-0.65□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RRT1YBL048W CWP2P43497 92 aa-0.66□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YBR200W-AQ3E755 54 aa-0.66□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YGR121W-AQ3E816 71 aa-0.66□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa-0.66□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W TY3B-GQ99315 1547 aa-0.68□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W QCR9P22289 66 aa-0.68□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W ESP1Q03018 1630 aa-0.68□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W SWM2P40342 146 aa-0.69□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YOR011W-AQ3E807 68 aa-0.69□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YGR035W-AQ45U48 73 aa-0.69□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa-0.7□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W YBL039W-BP0C268 59 aa-0.71□□□□□ -2.52
RRT1YBL048W FMP27Q06179 2628 aa-0.72□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W HAP1P0CE41 1502 aa-0.73□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W PAU7P39545 55 aa-0.76□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W FKS3Q04952 1785 aa-0.76□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W YPR117WQ06116 2489 aa-0.76□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W TIM12P32830 109 aa-0.77□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W SSS1P35179 80 aa-0.78□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W RPS27BP38711 82 aa-0.78□□□□□ -2.53
RRT1YBL048W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W YHR050W-AQ05451 56 aa-0.79□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa-0.8□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W HUB1Q6Q546 73 aa-0.81□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W MEC1P38111 2368 aa-0.81□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa-0.82□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W YLL006W-AQ3E814 58 aa-0.82□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W SPI1P40092 148 aa-0.83□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W ERI1P62651 68 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W COA2Q3E823 68 aa-0.84□□□□□ -2.54
RRT1YBL048W DNF2Q12675 1612 aa-0.85□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa-0.85□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W DOP1Q03921 1698 aa-0.86□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W UFD4P33202 1483 aa-0.86□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W IML1P47170 1584 aa-0.87□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W YBR230W-AQ3E762 66 aa-0.87□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W YGL258W-AQ3E740 77 aa-0.88□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W VPS15P22219 1454 aa-0.88□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W IQG1Q12280 1495 aa-0.89□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W TEL1P38110 2787 aa-0.91□□□□□ -2.55
RRT1YBL048W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa-0.91□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W PDR12Q02785 1511 aa-0.92□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W YOR072W-BQ3E832 53 aa-0.93□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W YFL041W-AQ3E817 63 aa-0.94□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W NUP159P40477 1460 aa-0.94□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W BCK1Q01389 1478 aa-0.94□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W RPO31P04051 1460 aa-0.95□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W YLR157W-DP0CE99 70 aa-0.96□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W VMR1P38735 1592 aa-0.96□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W YSY6P38374 65 aa-0.97□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W YOL131WQ08270 108 aa-0.97□□□□□ -2.56
RRT1YBL048W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W DNF1P32660 1571 aa-0.99□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa-0.99□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W SCC2Q04002 1493 aa-1□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W FIG2P25653 1609 aa-1□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W TY1B-DR4Q07793 1604 aa-1.01□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W PAI3P01094 68 aa-1.02□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W DYN1P36022 4092 aa-1.02□□□□□ -2.57
RRT1YBL048W YOR093CQ12275 1648 aa-1.05□□□□□ -2.58
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