RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 FIBCD1Q8N539 461 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP57Q96MR6 1250 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 AAASQ9NRG9 546 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF8O76064 485 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SDC4P31431 198 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PPM1AP35813 382 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN9P43378 593 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPP19P56211 112 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 DSG1Q02413 1049 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 KATNAL2Q8IYT4 538 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf48Q96LL4 319 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PGLYRP2Q96PD5 576 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CDY1Q9Y6F8 540 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 USP3Q9Y6I4 520 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR11A4FU01 709 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF10BO14763 440 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED1O96006 694 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PCK1P35558 622 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-215ENST00000628018 POLNQ7Z5Q5 900 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 ATAD1Q8NBU5 361 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA1Q92805 767 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD9AQ99638 391 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-215ENST00000628018 DAB1O75553 588 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 VNN2O95498 520 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L7P0C7H9 530 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 GLUD2P49448 558 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SEL1L2Q5TEA6 688 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 IRGQQ8WZA9 623 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 DPF3Q92784 378 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM149B1Q96BN6 582 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-215ENST00000628018 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB106AQ8N104 65 aa26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD8Q96I13 439 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 PLVAPQ9BX97 442 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 V9GYY5 206 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-215ENST00000628018 E7ENQ6 273 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 IL1R2P27930 398 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A3P53794 718 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP11AP98196 1134 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ROR1Q01973 937 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf54Q08AI8 447 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 EXD1Q8NHP7 514 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN4Q92575 508 aa26.05■■□□□ 1.76
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CAPNS1-215ENST00000628018 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR27A2RRH5 827 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 DESP17661 470 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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CAPNS1-215ENST00000628018 GJC1P36383 396 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 CDO1Q16878 200 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB6CQ53S08 254 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC9BQ8N6N2 239 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5C3BQ969T7 300 aa26.04■■□□□ 1.76
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