RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 HINFPQ9BQA5 517 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PIDD1Q9HB75 910 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ACP6Q9NPH0 428 aa22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.228e-7■■■■■ 89.9
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRJQ12913 1337 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 KRT19P08727 400 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 KRT5P13647 590 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TAF6P49848 677 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SH3GL2Q99962 352 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 NFU1Q9UMS0 254 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 FGGP02679 453 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ITGB3P05106 788 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 MYBL1P10243 752 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ODC1P11926 461 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CTNNA2P26232 953 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ELF1P32519 619 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 GGCXP38435 758 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ALG3Q92685 438 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM11Q96F44 468 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 POMKQ9H5K3 350 aa22.68■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PLXNA3P51805 1871 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SPTLC1O15269 473 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 RNF40O75150 1001 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TNNC2P02585 160 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PEX5P50542 639 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 BIRC3Q13489 604 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CUL2Q13617 745 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SV2CQ496J9 727 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 WDR49Q8IV35 697 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF653Q96CK0 615 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF560Q96MR9 790 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 NUP85Q9BW27 656 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.67■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CYB561D2O14569 222 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 C8AP07357 584 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PNPLA4P41247 253 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 METTL23Q86XA0 190 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 IFT81Q8WYA0 676 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.223e-7■■■□□ 15
SGMS1-210ENST00000619438 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 NR2E1Q9Y466 385 aa22.66■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ESYT3A0FGR9 886 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC66A2RUB6 948 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 KPNA7A9QM74 516 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 OPA1O60313 960 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 OAZ2O95190 189 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CPB1P15086 417 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 COMTP21964 271 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 RBP5P82980 135 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 ROR1Q01973 937 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 POLIQ9UNA4 740 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D4O60343 1298 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 HSF2BPO75031 334 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 TYMPP19971 482 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 MESDQ14696 234 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 IQCKQ8N0W5 287 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 FAM84AQ96KN4 292 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SGMS1-210ENST00000619438 DSEQ9UL01 958 aa22.65■■□□□ 1.22
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