RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RSPH3Q86UC2 560 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RNF148Q8N7C7 305 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 MMP19Q99542 508 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 AMNQ9BXJ7 453 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RNF19AQ9NV58 838 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EBF1Q9UH73 591 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 USTQ9Y2C2 406 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0C4DFX4 3053 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EMSYQ7Z589 1322 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PDXKO00764 312 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CYB561D2O14569 222 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 LPXNO60711 386 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CD58P19256 250 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 GABPAQ06546 454 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SNAPC2Q13487 334 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 USP33Q8TEY7 942 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 HSPH1Q92598 858 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TEKT1Q969V4 418 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CCT7Q99832 543 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TPK1Q9H3S4 243 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SIAEQ9HAT2 523 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ITM2AO43736 263 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FKBP6O75344 327 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KRT38O76015 456 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KRT10P13645 584 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NR4A1P22736 598 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 RPA1P27694 616 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BCAP31P51572 246 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GPS1Q13098 491 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CD101Q93033 1021 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 WNK4Q96J92 1243 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP3Q96P47 875 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 STK24Q9Y6E0 443 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GAKO14976 1311 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 YDJCA8MPS7 323 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN14A8MX76 684 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BTBD19C9JJ37 291 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 F5H6K3 240 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 EML1O00423 815 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MEIS2O14770 477 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 BBOX1O75936 387 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GGPS1O95749 300 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 IDO1P14902 403 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 FMO5P49326 533 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TMPRSS15P98073 1019 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 NRF1Q16656 503 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2A13Q16696 494 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ODR4Q5SWX8 454 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CES4AQ5XG92 561 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 SYT11Q9BT88 431 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 GINM1Q9NU53 330 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 HESX1Q9UBX0 185 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 ASTN1O14525 1302 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 LAMB1P07942 1786 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRT-211ENST00000618610 MSH4O15457 936 aa8.51□□□□□ -1.05
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