RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	GIPC2	Q8TF65	315 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	YIPF1	Q9Y548	306 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBED1	O96006	694 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT3	P12035	628 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLCN4	P51793	760 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP46	P62068	366 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC6A3	Q01959	620 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTMR3	Q13615	1198 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUP93	Q8N1F7	819 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCEE	Q96PE7	176 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP3	Q9Y6I4	520 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOCS3	O95396	460 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTBD6	Q96KE9	485 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA17	Q96L03	361 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH1A3	P47895	512 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TWF1	Q12792	350 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMC1	Q8N766	993 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87	2e-9	■■□□□ 12.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAFF	Q9ULX9	164 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	C5orf42	Q9H799	3197 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576		E7ENQ6	273 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO21	O94952	628 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	C8A	P07357	584 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAOA	P59103	153 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCEAL1	Q15170	157 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTA2	O94776	668 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPCAM	P16422	314 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLT3	P36888	993 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLE6	Q9H808	572 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLXNA3	P51805	1871 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PATJ	Q8NI35	1801 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF5C	O60282	957 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRIP1	P48552	1158 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGF	P49763	221 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRNP1	Q6NT89	227 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL37	Q9NZH6	218 aa		9.61	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO1F	O00160	1098 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PALM	O75781	387 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	YWHAQ	P27348	245 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	OGDH	Q02218	1023 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	MESD	Q14696	234 aa		9.6	□□□□□ -0.87
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRO	Q16827	1216 aa		9.6	□□□□□ -0.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms