RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 SOAT2O75908 522 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PAPLNO95428 1278 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 LRG1P02750 347 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CALB1P05937 261 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 H2AFZP0C0S5 128 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC175P0C221 793 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MYBL1P10243 752 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ATF6P18850 670 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ABCB4P21439 1286 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MMP8P22894 467 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 HOXA9P31269 272 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MAGEA1P43355 309 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GABRB2P47870 512 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GPR15P49685 360 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 RGS7P49802 495 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SLC5A3P53794 718 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ITIH3Q06033 890 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ADIGQ0VDE8 80 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TWF1Q12792 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 VEPH1Q14D04 833 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TAF12Q16514 161 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 AAK1Q2M2I8 961 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 HS1BP3Q53T59 392 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 RAB41Q5JT25 222 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CES5AQ6NT32 575 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 H2AFVQ71UI9 128 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MON1BQ7L1V2 547 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 RTL10Q7L3V2 364 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 KIAA1328Q86T90 577 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM110Q86TL2 294 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 NUP93Q8N1F7 819 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SUSD6Q92537 303 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 C18orf8Q96DM3 657 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SPATA17Q96L03 361 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ASB2Q96Q27 587 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 DESI2Q9BSY9 194 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 EHD2Q9NZN4 543 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 INTUQ9ULD6 942 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 YIPF1Q9Y548 306 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PIK3R2O00459 728 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TNFRSF10BO14763 440 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 FBXO21O94952 628 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ERBB2P04626 1255 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM253P0C7T8 217 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CSH1P0DML2 217 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CSH2P0DML3 217 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 BMP1P13497 986 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 LCP1P13796 627 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 MTHFRP42898 656 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 TKTL1P51854 596 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 VAV2P52735 878 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 EPHB3P54753 998 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GALCP54803 685 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GPC5P78333 572 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 NTHL1P78549 312 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PTP4A2Q12974 167 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 C2CD6Q53TS8 623 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ITIH5Q86UX2 942 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 XYLT1Q86Y38 959 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ELMOD1Q8N336 334 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 C3orf20Q8ND61 904 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GPR152Q8TDT2 470 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 GIPC2Q8TF65 315 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF653Q96CK0 615 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms