RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555540.1

KRT18P6-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P6, Length 1,265 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P6-201ENST00000555540 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.66■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.66■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.66■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 YEATS4O95619 227 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 ADH5P11766 374 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 TIE1P35590 1138 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 TTC30AQ86WT1 665 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 FBXO32Q969P5 355 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.65■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
KRT18P6-201ENST00000555540 ATP8B3O60423 1300 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 E2F8A0AVK6 867 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SGK1O00141 431 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CASP1P29466 404 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 GRIA2P42262 883 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 OTUB2Q96DC9 234 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 KCNK16Q96T55 309 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 TMEM9BQ9NQ34 198 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.64■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PATE3B3GLJ2 98 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 COCHO43405 550 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PHACTR2O75167 634 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 P2RY2P41231 377 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 TNFRSF4P43489 277 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CASP4P49662 377 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CDH8P55286 799 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 KDSRQ06136 332 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 EOGTQ5NDL2 527 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 HECTD3Q5T447 861 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 EMC10Q5UCC4 262 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 FAM35AQ86V20 835 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 WHAMMQ8TF30 809 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 IL37Q9NZH6 218 aa21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 TNFRSF10BO14763 440 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 GIPC1O14908 333 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 EXOC3O60645 756 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 GAD2Q05329 585 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF699Q32M78 642 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 RLN3Q8WXF3 142 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PIGKQ92643 395 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SPACA7Q96KW9 195 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 MED10Q9BTT4 135 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.62■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ADAM23O75077 832 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 TUBP50607 506 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 AP3M2P53677 418 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SLC5A3P53794 718 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 BIRC3Q13489 604 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 LPCAT2Q7L5N7 544 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 TNIP3Q96KP6 325 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 COMMD8Q9NX08 183 aa21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 FAM92AA1XBS5 289 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CLDN10P78369 228 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 IRX4P78413 519 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 CUL4BQ13620 913 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 NCOA4Q13772 614 aa21.6■■□□□ 1.05
KRT18P6-201ENST00000555540 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms