RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	LEFTY2	O00292	366 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985		O00370	1275 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	COCH	O43405	550 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PFKL	P17858	780 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF132	P52740	706 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC7A9	P82251	487 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GCNT1	Q02742	428 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TCF15	Q12870	199 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FZD5	Q13467	585 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	MTF1	Q14872	753 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PQH9	124 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PAEP	P09466	180 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	VDR	P11473	427 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TCF3	P15923	654 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PON1	P27169	355 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CTH	P32929	405 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	BCAT1	P54687	386 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE4C	Q08493	712 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	STX1A	Q16623	288 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM3C	Q92520	227 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	WBP2	Q969T9	261 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	BECN2	A8MW95	431 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TLR5	O60602	858 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	GABBR2	O75899	941 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	TBX18	O95935	607 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT5	P13647	590 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE6C	P51160	858 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	RUNX3	Q13761	415 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	EML3	Q32P44	896 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TPCN1-223	ENST00000552985	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51

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