RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 GMIPQ9P107 970 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1B0GVT2 93 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 NCAM1P13591 858 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CD6P30203 668 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 KCNK18Q7Z418 384 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TMPRSS12Q86WS5 348 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CHPFQ8IZ52 775 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DEC1Q9P2X7 70 aa25.17■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PFKFB2O60825 505 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 ABL1P00519 1130 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 GAD2Q05329 585 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SV2CQ496J9 727 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DCAF12L1Q5VU92 463 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TERB1Q8NA31 727 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 BAP1Q92560 729 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 ACBD6Q9BR61 282 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DACH1Q9UI36 760 aa25.16■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 WISP1O95388 367 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 JUPP14923 745 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 SDE2Q6IQ49 451 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 L1RE1Q9UN81 338 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 DERAQ9Y315 318 aa25.15■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 PP2D1A8MPX8 630 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 B8ZZF3 427 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 ACOT2P49753 483 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 TLE3Q04726 772 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 OSTM1Q86WC4 334 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.14■■□□□ 1.62
PRDM4-202ENST00000547188 COL12A1Q99715 3063 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 A0A0B4J269 797 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 KCNK3O14649 394 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 PFKLP17858 780 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 GUCY2CP25092 1073 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 CDC25AP30304 524 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 LY6DQ14210 128 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 ANO4Q32M45 955 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 GABRG3Q99928 467 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 NUMA1Q14980 2115 aa25.13■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 WASH3PC4AMC7 463 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 OLFM2O95897 454 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 KIF19Q2TAC6 998 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SLC39A4Q6P5W5 647 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 C2CD2Q9Y426 696 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SNX11Q9Y5W9 270 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 MYH10P35580 1976 aa25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 KCNJ18B7U540 433 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 KRT10P13645 584 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 GRK6P43250 576 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 MYL7Q01449 175 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM25Q86YD3 366 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SPACA3Q8IXA5 215 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TIPINQ9BVW5 301 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa25.11■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 METTL12A8MUP2 240 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM66O15016 1216 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SLC28A2O43868 658 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 ATP2C2O75185 946 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 HNF1BP35680 557 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 NCKAP1LP55160 1127 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 NECAB1Q8N987 351 aa25.1■■□□□ 1.61
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