RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746		F8W8V4	182 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	NFIB	O00712	420 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FCHO1	O14526	889 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF11	O14901	512 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC22	O60826	627 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	BANF1	O75531	89 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	HAUS5	O94927	633 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMG1	O95456	288 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GSTA2	P09210	222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GNAT1	P11488	350 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT4	P19013	534 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ALDH1B1	P30837	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SFN	P31947	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CAP2	P40123	477 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CETN2	P41208	172 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PIK3CA	P42336	1068 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL4C	P56559	192 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SOX10	P56693	466 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MXRA7	P84157	204 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT76	Q01546	638 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K10	Q02779	954 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CDK18	Q07002	472 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TFDP1	Q14186	410 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	HIF1A	Q16665	826 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	XKR9	Q5GH70	373 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RINL	Q6ZS11	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TEKT4	Q8WW24	435 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM151A	Q8WW52	585 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	NCSTN	Q92542	709 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GATA6	Q92908	595 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MASTL	Q96GX5	879 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CSRNP1	Q96S65	589 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PAFAH2	Q99487	392 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SYNC	Q9H7C4	482 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	HEY2	Q9UBP5	337 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	C2CD2	Q9Y426	696 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58

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