RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CGB1A6NKQ9 187 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CCER2I3L3R5 266 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SMIM22K7EJ46 135 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SRGAP2O75044 1071 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TCEA3O75764 348 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 RASSF9O75901 435 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 JTBO76095 146 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PDE8BO95263 885 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 KLRC1P26715 233 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PEX2P28328 305 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FOXF2Q12947 444 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 GALEQ14376 348 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SPARTQ8N0X7 666 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PJA1Q8NG27 643 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TIFAQ96CG3 184 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SARGQ9BW04 601 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC27Q9C0I9 530 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 COL20A1Q9P218 1284 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 H7C4K7 107 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 GOLIM4O00461 696 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MGEA5O60502 916 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MYL3P08590 195 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MYF5P13349 255 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 HTR3AP46098 478 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ITGA8P53708 1063 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FAM193AP78312 1265 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FMO1Q01740 532 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CYP1B1Q16678 543 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ANO1Q5XXA6 986 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF280DQ6N043 979 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MORC1Q86VD1 984 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SESTD1Q86VW0 696 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TEX19Q8NA77 164 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 GABRQQ9UN88 632 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 RASAL1O95294 804 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 HRGP04196 525 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 E2F1Q01094 437 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PROSER3Q2NL68 480 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 APIPQ96GX9 242 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PRR25Q96S07 402 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 AP4M1O00189 453 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RGS10O43665 173 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TJP3O95049 919 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RHCEP18577 417 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 FPR3P25089 353 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ABCG1P45844 678 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RHDQ02161 417 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CCNIQ14094 377 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 INSCQ1MX18 579 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC70Q6NSX1 233 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CPXCR1Q8N123 301 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 APOL5Q9BWW9 433 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 LUZP4Q9P127 313 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF69Q9UC07 566 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms