RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CNTNAP1P78357 1384 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NEDD4P46934 1319 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NAV1Q8NEY1 1877 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DTNBO60941 627 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 EYA4O95677 639 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MCCP23508 829 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SREBF1P36956 1147 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GUCY1B3Q02153 619 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ANO4Q32M45 955 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AFMIDQ63HM1 303 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DRC7Q8IY82 874 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 COG1Q8WTW3 980 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 IDI2Q9BXS1 227 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SCOCQ9UIL1 159 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FOCADQ5VW36 1801 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DRGXA6NNA5 263 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NMT2O60551 498 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ENTPD3O75355 529 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ENDOD1O94919 500 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CASTP20810 708 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 BMPR1AP36894 532 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GPR3P46089 330 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AVPR1BP47901 424 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 COL10A1Q03692 680 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MALLQ13021 153 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SBK1Q52WX2 424 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 Q6YL49 198 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MOB2Q70IA6 237 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CERS3Q8IU89 383 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GPR150Q8NGU9 434 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FAM151AQ8WW52 585 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NEK1Q96PY6 1258 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NEU1Q99519 415 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MRI1Q9BV20 369 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 LDAHQ9H6V9 325 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM140Q9NV12 185 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DNM3Q9UQ16 869 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 LAMA4Q16363 1823 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SIPA1L1O43166 1804 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SCN4AP35499 1836 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PRC1O43663 620 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1B1P15121 316 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PROZP22891 400 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SHMT1P34896 483 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH1A3P47895 512 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MMP14P50281 582 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TFAP4Q01664 338 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TRDNQ13061 729 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TP53BP2Q13625 1128 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TNFAIP1Q13829 316 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP1CQ5VVH2 108 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MED25Q71SY5 747 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NCOA7Q8NI08 942 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 STON2Q8WXE9 905 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CAVIN3Q969G5 261 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC18Q9H819 358 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.47□□□□□ -1.53
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