RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	LEFTY2	O00292	366 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK25	O00506	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MDM4	O15151	490 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MBD3	O95983	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD19	P15391	556 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDC	P19113	662 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTH	P32929	405 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC7A9	P82251	487 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCNT1	Q02742	428 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PQH9	124 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	BECN2	A8MW95	431 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959		H0Y858	1186 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GABBR2	O75899	941 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBX18	O95935	607 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCF3	P15923	654 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF11	P52732	1056 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NHLH1	Q02575	133 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE4C	Q08493	712 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EML3	Q32P44	896 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EML5	Q05BV3	1969 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0QYV0	167 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLR5	O60602	858 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRF1	P10914	325 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	VDR	P11473	427 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PON1	P27169	355 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCAT1	P54687	386 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PON2	Q15165	354 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	STX1A	Q16623	288 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZS52	159 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM3C	Q92520	227 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHD	Q96IW2	340 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIK3R2	O00459	728 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GREM1	O60565	184 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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