RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 GKN1Q9NS71 199 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TSPAN16Q9UKR8 245 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SIT1Q9Y3P8 196 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 WDFY4Q6ZS81 3184 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 F5P12259 2224 aa17.39■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ18B7U540 433 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PGFP49763 221 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 USP4Q13107 963 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ12Q14500 433 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 STX1AQ16623 288 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 HECTD3Q5T447 861 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC186Q7Z3E2 898 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PJA1Q8NG27 643 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TFAP2BQ92481 460 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MSANTD3Q96H12 275 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ZFYVE19Q96K21 471 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SIX2Q9NPC8 291 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MUC6Q6W4X9 2439 aa17.38■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MFAP3P55082 362 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PDE4CQ08493 712 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 KCNMA1Q12791 1236 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MTF1Q14872 753 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 STILQ15468 1287 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf228Q6PIY5 440 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TPRG1Q6ZUI0 275 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PIGZQ86VD9 579 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SH3RF2Q8TEC5 729 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SLC35F5Q8WV83 523 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 KCTD13Q8WZ19 329 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CLDN23Q96B33 292 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CYLDQ9NQC7 956 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 GTSE1Q9NYZ3 720 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 GMIPQ9P107 970 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17.37■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 COL4A3Q01955 1670 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 LEFTY2O00292 366 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 STK25O00506 426 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 COCHO43405 550 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ABL1P00519 1130 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CD72P21854 359 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2G4AP47712 749 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PSEN1P49768 467 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 BCAT1P54687 386 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SLC8A3P57103 927 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 BST2Q10589 180 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 NCAPHQ15003 741 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PDGFRLQ15198 375 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MEA1Q16626 185 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 KLHDC10Q6PID8 442 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SCD5Q86SK9 330 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 OSCP1Q8WVF1 389 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 FOXQ1Q9C009 403 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CCSER2Q9H7U1 834 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 HPS4Q9NQG7 708 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 FANCLQ9NW38 375 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 OSER1Q9NX31 292 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 HESX1Q9UBX0 185 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 HELZP42694 1942 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 FAM170BA6NMN3 283 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TULP2O00295 520 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CD19P15391 556 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 MYL5Q02045 173 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TYRO3Q06418 890 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 TNK2Q07912 1038 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 RUNX3Q13761 415 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 KLHL40Q2TBA0 621 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 GJB7Q6PEY0 223 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.35■□□□□ 0.37
ATG4B-216ENST00000475195 SCML4Q8N228 414 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms