RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 BCAT1P54687 386 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 USP4Q13107 963 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 MTF1Q14872 753 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 PDGFRLQ15198 375 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 STILQ15468 1287 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 ZNF77Q15935 545 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 STX1AQ16623 288 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 EXOC3L4Q17RC7 722 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 VWA3BQ502W6 1294 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TRIM65Q6PJ69 517 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KIAA1958Q8N8K9 716 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 FAM83CQ9BQN1 747 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 FOXQ1Q9C009 403 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 RNF38Q9H0F5 515 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 NDST4Q9H3R1 872 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 LTB4R2Q9NPC1 389 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 GKN1Q9NS71 199 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 GMIPQ9P107 970 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TSPAN16Q9UKR8 245 aa12.31□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 FAM170BA6NMN3 283 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KCNJ18B7U540 433 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CD72P21854 359 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KIF11P52732 1056 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 PTPN5P54829 565 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 MFAP3P55082 362 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 AMPD2Q01433 879 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 BST2Q10589 180 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 RUNX3Q13761 415 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KCNJ12Q14500 433 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TCP11X2Q5H9J9 407 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 ARHGEF19Q8IW93 802 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CCDC105Q8IYK2 499 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TTC16Q8NEE8 873 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SH3RF2Q8TEC5 729 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 FAM3CQ92520 227 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KAT5Q92993 513 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 NACA2Q9H009 215 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 GTSE1Q9NYZ3 720 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 APEX2Q9UBZ4 518 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 LEFTY2O00292 366 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 O00370 1275 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CYP26A1O43174 497 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 COCHO43405 550 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 DCNP07585 359 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TPM2P07951 284 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SETSIPP0DME0 302 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KRT5P13647 590 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SLC9A1P19634 815 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 PTMSP20962 102 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 PON1P27169 355 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 IFNAR2P48551 515 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TNK2Q07912 1038 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CNGA2Q16280 664 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 LCLAT1Q6UWP7 414 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CCDC186Q7Z3E2 898 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TADA2BQ86TJ2 420 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 PIGZQ86VD9 579 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TTC30AQ86WT1 665 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 ARHGAP18Q8N392 663 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CPA6Q8N4T0 437 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 DTWD2Q8NBA8 298 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 ATP2A3Q93084 1043 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 EXOC4Q96A65 974 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KREMEN1Q96MU8 473 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 EBF3Q9H4W6 596 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CNTN6Q9UQ52 1028 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 CPQQ9Y646 472 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 USP3Q9Y6I4 520 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 VPS13AQ96RL7 3174 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-204ENST00000464280 MED7O43513 233 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms