RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	IER5L	Q5T953	404 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	IRF7	Q92985	503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	WNT16	Q9UBV4	365 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	F5	P12259	2224 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A1W2PQH9	124 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	HHLA1	C9JL84	531 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TULP2	O00295	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970		O00370	1275 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	PIK3R2	O00459	728 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	LCP1	P13796	627 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CD72	P21854	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	GNA15	P30679	374 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	IFNAR2	P48551	515 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TKTL1	P51854	596 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	UBXN1	Q04323	297 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	HECTD3	Q5T447	861 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	PIGZ	Q86VD9	579 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SHD	Q96IW2	340 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SIX2	Q9NPC8	291 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	COMMD8	Q9NX08	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM170A	A1A519	330 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CHAD	O15335	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	COCH	O43405	550 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	MED7	O43513	233 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SOX9	P48436	509 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	PGF	P49763	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	KLK7	P49862	253 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	KIF11	P52732	1056 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF132	P52740	706 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TPM4	P67936	248 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TNK2	Q07912	1038 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ADIG	Q0VDE8	80 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	MTF1	Q14872	753 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	NCAPH	Q15003	741 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	SYCP1	Q15431	976 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	STIL	Q15468	1287 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	CNGA2	Q16280	664 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	RNF38	Q9H0F5	515 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	EBF3	Q9H4W6	596 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	NMUR1	Q9HB89	426 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD4-208	ENST00000462970	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms