RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 NCAPGQ9BPX3 1015 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 RAB6CQ9H0N0 254 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 NME7Q9Y5B8 376 aa28.87■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.86■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 GSTA1P08263 222 aa28.86■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 TSHRP16473 764 aa28.86■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 RABGEF1Q9UJ41 708 aa28.86■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SUN1O94901 812 aa28.85■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.85■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.85■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 KRT15P19012 456 aa28.85■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 KRT81Q14533 505 aa28.85■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 CDHR5Q9HBB8 845 aa28.85■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.85■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa28.84■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 ASMTLO95671 621 aa28.84■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 DENND1AQ8TEH3 1009 aa28.84■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 FAM172AQ8WUF8 416 aa28.84■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 SLC12A4Q9UP95 1085 aa28.84■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 ZNF487B1APH4 448 aa28.83■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 MDM4O15151 490 aa28.83■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 SSTR1P30872 391 aa28.83■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 RTP4Q96DX8 246 aa28.83■■■□□ 2.21
CERS1-201ENST00000429504 DHRS4Q9BTZ2 278 aa28.83■■■□□ 2.21
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CERS1-201ENST00000429504 TAC1P20366 129 aa28.82■■■□□ 2.2
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CERS1-201ENST00000429504 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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CERS1-201ENST00000429504 CBLBQ13191 982 aa28.82■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 KCNJ11Q14654 390 aa28.82■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 SCYL2Q6P3W7 929 aa28.82■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 GRAMD1AQ96CP6 724 aa28.82■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 ZNF670Q9BS34 389 aa28.82■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 CFAP69A5D8W1 941 aa28.81■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 APOL1O14791 398 aa28.81■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 SPAG7O75391 227 aa28.81■■■□□ 2.2
CERS1-201ENST00000429504 GABBR2O75899 941 aa28.81■■■□□ 2.2
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