RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC142Q17RM4 750 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SORBS3O60504 671 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SNX27Q96L92 541 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 WEE2P0C1S8 567 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ITGAXP20702 1163 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC1A6P48664 564 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AQP4P55087 323 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 COG2Q14746 738 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TTC16Q8NEE8 873 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCNCP24863 283 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PICK1Q9NRD5 415 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DLC1Q96QB1 1528 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RNF103O00237 685 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C4orf22Q6V702 233 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PDSS2Q86YH6 399 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 P3H2Q8IVL5 708 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NLRP3Q96P20 1036 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CENPBD1B2RD01 187 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GLRA3O75311 464 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KCNJ1P48048 391 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KCNQ4P56696 695 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CDC16Q13042 620 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TP53BP2Q13625 1128 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NCAPD2Q15021 1401 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SETD9Q8NE22 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KRT35Q92764 455 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ILVBLA1L0T0 632 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TPPPO94811 219 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ATF3P18847 181 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TPTEP56180 551 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HM13Q8TCT9 377 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PIDD1Q9HB75 910 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCRL2O00421 344 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DGKIO75912 1065 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HOXC9P31274 260 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NADK2Q4G0N4 442 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 WDR59Q6PJI9 974 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IRGQQ8WZA9 623 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TCIRG1Q13488 830 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TFDP2Q14188 446 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NACC1Q96RE7 527 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IL25Q9H293 177 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM13O60858 407 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TGDSO95455 350 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PDGFRBP09619 1106 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ITGA4P13612 1032 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CRABP2P29373 138 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ADSSP30520 456 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MICALL2Q8IY33 904 aa6.67□□□□□ -1.34
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