RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TRIM24O15164 1050 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 MAP3K13O43283 966 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 APODP05090 189 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CYP27A1Q02318 531 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 MYO1EQ12965 1108 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 EOGTQ5NDL2 527 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 BRAPQ7Z569 592 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 GPD1LQ8N335 351 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 DEFB119Q8N690 84 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 A0A1W2PQF6 199 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TRIM66O15016 1216 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TACC1O75410 805 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ADH5P11766 374 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CD59P13987 128 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 GABRG2P18507 467 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 KDSRQ06136 332 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 RESTQ13127 1097 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 PANK2Q9BZ23 570 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SLC32A1Q9H598 525 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 IL37Q9NZH6 218 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.16■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 E2F8A0AVK6 867 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ZNF233A6NK53 670 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CLDN5O00501 218 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 COCHO43405 550 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 GREM1O60565 184 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ABL1P00519 1130 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SERPINF2P08697 491 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 FAM163BP0C2L3 166 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 IDEP14735 1019 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 HOXD12P35452 270 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 PGFP49763 221 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ALCAMQ13740 583 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 TMEM25Q86YD3 366 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 NAT16Q8N8M0 369 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 ZNF516Q92618 1163 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 HPS3Q969F9 1004 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SPACA7Q96KW9 195 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 MMS19Q96T76 1030 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 PANK4Q9NVE7 773 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 LHX6Q9UPM6 363 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.15■□□□□ 0.02
NFE4-201ENST00000420058 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 TULP3O75386 442 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 GJB3O75712 270 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 ADH1CP00326 375 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 ANXA13P27216 316 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 WDR49Q8IV35 697 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 KCNK16Q96T55 309 aa15.14■□□□□ 0.01
NFE4-201ENST00000420058 ACOX2Q99424 681 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms