RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.81■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 AMACRQ9UHK6 382 aa22.81■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 USP18Q9UMW8 372 aa22.81■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 KRT1P04264 644 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 PCK1P35558 622 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 PTPRSQ13332 1948 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 PATJQ8NI35 1801 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SDC4P31431 198 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ADCY2Q08462 1091 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 STIM2Q9P246 746 aa22.8■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CYP1B1Q16678 543 aa22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.79■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 PHF2O75151 1096 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 EFEMP2O95967 443 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 KRT7P08729 469 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 KRT10P13645 584 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CAPN2P17655 700 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CYP2F1P24903 491 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 PTPN9P43378 593 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 HDAC4P56524 1084 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 DAOAP59103 153 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 BRD3Q15059 726 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 RTP2Q5QGT7 225 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 TTC27Q6P3X3 843 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 DEFB106AQ8N104 65 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC151A5D8V7 595 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 HSF2BPO75031 334 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 FYNP06241 537 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 USP17L7P0C7H9 530 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 MYBL2P10244 700 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 TMEM199Q8N511 208 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.247e-6■■■■□ 21.6
RBMS1-205ENST00000409972 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 LRRD1A4D1F6 860 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 E7ENQ6 273 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 TTI1O43156 1089 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CD48P09326 243 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 MATKP42679 507 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CDKN2BP42772 138 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 TRADDQ15628 312 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.77■■□□□ 1.24
RBMS1-205ENST00000409972 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 TBC1D4O60343 1298 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 FBXO21O94952 628 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 AMHP03971 560 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 TUBBP07437 444 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 KDELR1P24390 212 aa22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RBMS1-205ENST00000409972 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms