RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402077.7

KCTD17-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD17, Length 1,691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17-201ENST00000402077 DNAJB2P25686 324 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 GJC1P36383 396 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 PTGIRP43119 386 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 PDE4CQ08493 712 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 BST2Q10589 180 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TTC27Q6P3X3 843 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CD300LGQ6UXG3 332 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CCDC50Q8IVM0 306 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 RCOR2Q8IZ40 523 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 HERPUD2Q9BSE4 406 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TSC2P49815 1807 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TULP2O00295 520 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CCDC130P13994 396 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ECHS1P30084 290 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 PPM1AP35813 382 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 COILP38432 576 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SNX16P57768 344 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TRADDQ15628 312 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 OR6B2Q6IFH4 312 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 JAMLQ86YT9 394 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SLC39A11Q8N1S5 342 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 EMC1Q8N766 993 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 IGSF21Q96ID5 467 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SENP8Q96LD8 212 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CYLDQ9NQC7 956 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SPG21Q9NZD8 308 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 RASAL2Q9UJF2 1139 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 HPCAL4Q9UM19 191 aa29.41■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 LRCH4O75427 683 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TADA2AO75478 443 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 RALAP11233 206 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CTNNB1P35222 781 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 BMPR1AP36894 532 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 RPL34P49207 117 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 RGS7P49802 495 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 WSCD1Q658N2 575 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 OLFML1Q6UWY5 402 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TRIM51Q9BSJ1 452 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 OSBPL8Q9BZF1 889 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 FAM114A2Q9NRY5 505 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 KRT1P04264 644 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 PTPN7P35236 360 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 CETN2P41208 172 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 COPS2P61201 443 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 PPP2R2DQ66LE6 453 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SPRED2Q7Z698 418 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TMEM86AQ8N2M4 240 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SLITRK1Q96PX8 696 aa29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 PAX3P23760 479 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ADORA2BP29275 332 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 DUPD1Q68J44 220 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SLCO2A1Q92959 643 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 TMEM169Q96HH4 297 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ERP44Q9BS26 406 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 ACBD3Q9H3P7 528 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 SLC28A3Q9HAS3 691 aa29.39■■■□□ 2.3
KCTD17-201ENST00000402077 C2CD4BA6NLJ0 364 aa29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 BRCC3P46736 316 aa29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 SAMD11Q96NU1 681 aa29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 GABBR2O75899 941 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 KRT7P08729 469 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 GPD1P21695 349 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 TKTP29401 623 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 SLC6A3Q01959 620 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 HADHQ16836 314 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 SLC2A14Q8TDB8 520 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 TIFAQ96CG3 184 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 KLHL11Q9NVR0 708 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 ASNSD1Q9NWL6 643 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 C5orf67F2Z3F1 127 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 PIK3R2O00459 728 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 DPYSL4O14531 572 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 DAPK3O43293 454 aa29.37■■■□□ 2.29
KCTD17-201ENST00000402077 TRAPPC3O43617 180 aa29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms