RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 A8MXQ7 604 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 K7EQS6 105 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CLDN5O00501 218 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CUTAO60888 179 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PHACTR2O75167 634 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 TACC1O75410 805 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CYP17A1P05093 508 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PFKLP17858 780 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PPP3CCP48454 512 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 MYL6P60660 151 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SLC7A9P82251 487 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 TAF10Q12962 218 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 GAB4Q2WGN9 574 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ANO7Q6IWH7 933 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SHC4Q6S5L8 630 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 UNC13DQ70J99 1090 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 IQUBQ8NA54 791 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 USP33Q8TEY7 942 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF516Q92618 1163 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 C8orf48Q96LL4 319 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 EDEM2Q9BV94 578 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 EBF1Q9UH73 591 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 UBE4BO95155 1302 aa11.01□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 TM4SF5O14894 197 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 YEATS4O95619 227 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CAVIN2O95810 425 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 OLFM2O95897 454 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 BCKDHBP21953 392 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SLC6A11P48066 632 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CASP4P49662 377 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 KDSRQ06136 332 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 DHCR24Q15392 516 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 C12orf40Q86WS4 652 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 NUP93Q8N1F7 819 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 FBXO32Q969P5 355 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 C7orf25Q9BPX7 421 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 MED10Q9BTT4 135 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SLC39A2Q9NP94 309 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM30AQ9NV96 361 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 MMP17Q9ULZ9 603 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CACNA1AO00555 2505 aa11□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 FRYLO94915 3013 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 EXOC3O60645 756 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 KCNK5O95279 499 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 APODP05090 189 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 FAM163BP0C2L3 166 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ADH5P11766 374 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 YWHAQP27348 245 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PMLP29590 882 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 AFMP43652 599 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CDH8P55286 799 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 BIRC3Q13489 604 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PMS2CLQ68D20 193 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 FAM35AQ86V20 835 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 C11orf74Q86VG3 221 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 RASSF3Q86WH2 238 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ALLCQ8N6M5 410 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 MDGA1Q8NFP4 955 aa10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CLRN3-201ENST00000368671 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms