RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 DRC3Q9H069 523 aa16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 RIPK3Q9Y572 518 aa16.77■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 GHRP10912 638 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MIPP30301 263 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 C3orf20Q8ND61 904 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 BHMTQ93088 406 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TRIM15Q9C019 465 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TTC36A6NLP5 189 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SLC2A3P11169 496 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PPIL2Q13356 520 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 EDEM1Q92611 657 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 KLRG1Q96E93 195 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TMEM169Q96HH4 297 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 RIPK2O43353 540 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 RECQL4O94761 1208 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ADIGQ0VDE8 80 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 LINC00523Q86TU6 105 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SNX19Q92543 992 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 THTPAQ9BU02 230 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TRIM4Q9C037 500 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 NFASCO94856 1347 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 E5RJQ4 531 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ANP32DO95626 131 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CPA2P48052 419 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 POLE2P56282 527 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ZNF844Q08AG5 666 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MFSD10Q14728 455 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 LONP2Q86WA8 852 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 FBXO32Q969P5 355 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 FBXO21O94952 628 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TBCBQ99426 244 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 GDF3Q9NR23 364 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ALDH1A3P47895 512 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MARCKSL1P49006 195 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 FMO1Q01740 532 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MAPRE2Q15555 327 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ZNF410Q86VK4 478 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 E2F6O75461 281 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CCNE2O96020 404 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 HMGCRP04035 888 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SERPINB4P48594 390 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CORO7P57737 925 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TTC23LQ6PF05 361 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CEP41Q9BYV8 373 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CDT1Q9H211 546 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MYPNQ86TC9 1320 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 LYPLA2O95372 231 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SLC51AQ86UW1 340 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CCNJLQ8IV13 435 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 HES2Q9Y543 173 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SSTR1P30872 391 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TNFSF9P41273 254 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 PSEN2P49810 448 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 MTBPQ96DY7 904 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 TINF2Q9BSI4 451 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD3-201ENST00000322054 THEGQ9P2T0 379 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms