RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 RFX6Q8HWS3 928 aa23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFAP2BQ92481 460 aa23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 C7orf26Q96N11 449 aa23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP42A6NI28 874 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRF6O14896 467 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPR1P16066 1061 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 RANBP1P43487 201 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF132P52740 706 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRX4P78413 519 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 A6NJR5 290 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 OPHN1O60890 802 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 STBD1O95210 358 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1QAP02745 245 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 WWP1Q9H0M0 922 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.22■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPOXP36551 454 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEX44Q53QW1 395 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 RALGPS1Q5JS13 557 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCSTNQ92542 709 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 RMDN3Q96TC7 470 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SFNP31947 248 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT76Q01546 638 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA18Q8TC71 538 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSPH1Q92598 858 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM143Q96AN5 459 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMP19Q99542 508 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPME1Q9Y570 386 aa23.21■■□□□ 1.31
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A0B4J269 797 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAXCQ5TGI0 409 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIPK4Q8NE63 616 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPKQ9BS16 269 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALN1Q9BXU9 219 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 S100A14Q9HCY8 104 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 RFPL1O75677 317 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 APBA3O96018 575 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 EDN1P05305 212 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNFP41002 786 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMRN1Q13201 1228 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDSS2Q86YH6 399 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 EFCAB3Q8N7B9 438 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC13Q8NBP0 860 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCTD6Q8NC69 237 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.2■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAM2O75886 525 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR6B1O95007 311 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPHB1P54762 984 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASPHQ12797 758 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLA2G6O60733 806 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALDH1B1P30837 517 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 AQP4P55087 323 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLG1Q12959 904 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTERF2Q49AM1 385 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATG16L1Q676U5 607 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC26A7Q8TE54 656 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.19■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE5AO76074 875 aa23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT3P12035 628 aa23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENPEPQ07075 957 aa23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.18■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms