RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300648.6

GCN1-201, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCN1, Length 8,675 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-201ENST00000300648 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 SPON2Q9BUD6 331 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 HEY2Q9UBP5 337 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 ATP6V1G2O95670 118 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PIK3CGP48736 1102 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 HNMTP50135 292 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PRKAA1Q13131 559 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.66□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PIPSLA2A3N6 862 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PTPN21Q16825 1174 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 RGS21Q2M5E4 152 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 KRT77Q7Z794 578 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 THAP1Q9NVV9 213 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 SPATA2Q9UM82 520 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 ALOX5P09917 674 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 MSH3P20585 1137 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 GEMP55040 296 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 MS4A14Q96JA4 679 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 PRR29P0C7W0 189 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 SPATA33Q96N06 139 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 ALG6Q9Y672 507 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 FSBPO95073 299 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 NPR3P17342 541 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 COMTP21964 271 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 GRK3P35626 688 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 XIAPP98170 497 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 DNAJC3Q13217 504 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 GSTA3Q16772 222 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 DKK3Q9UBP4 350 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 RNF112Q9ULX5 631 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 OOSP2Q86WS3 158 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 AIFM3Q96NN9 605 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 SIK2Q9H0K1 926 aa11.65□□□□□ -0.54
GCN1-201ENST00000300648 GH2P01242 217 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FAM200BP0CF97 657 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SOAT1P35610 550 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CACNA2D1P54289 1103 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 NEK5Q6P3R8 708 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MZT2AQ6P582 158 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 REPS1Q96D71 796 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FUT8Q9BYC5 575 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 AHSPQ9NZD4 102 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.65□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ZNF185O15231 689 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 NR2C2P49116 596 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TUBA4AP68366 448 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 AGLP35573 1532 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SFI1A8K8P3 1242 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CASP12Q6UXS9 341 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 C9orf72Q96LT7 481 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 IQGAP1P46940 1657 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 SKP1P63208 163 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 MIEF2Q96C03 454 aa11.64□□□□□ -0.55
GCN1-201ENST00000300648 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms