RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 HES2Q9Y543 173 aa20.09■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 NME7Q9Y5B8 376 aa20.09■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 PIAS1O75925 651 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 XRCC4Q13426 336 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 PKDCCQ504Y2 493 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 PALM2Q8IXS6 379 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 RNF157Q96PX1 679 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 RNF19AQ9NV58 838 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 DERAQ9Y315 318 aa20.08■□□□□ 0.81
USP21-201ENST00000289865 SMAPO00193 183 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ADCY6O43306 1168 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 UBOX5O94941 541 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ACVR2BQ13705 512 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RASA2Q15283 850 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MTFR1Q15390 333 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FUKQ8N0W3 1084 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.08■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DPYSL4O14531 572 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CA4P22748 312 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SDC4P31431 198 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GTF2A2P52657 109 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC6A3Q01959 620 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GRB14Q14449 540 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SPARCL1Q14515 664 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PAFAH2Q99487 392 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 OSMRQ99650 979 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 HESX1Q9UBX0 185 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PDK2Q15119 407 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 BEST2Q8NFU1 509 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TINF2Q9BSI4 451 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.07■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GPR32O75388 356 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC18A1P54219 525 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 BOLA3Q53S33 107 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TMEM110Q86TL2 294 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SESTD1Q86VW0 696 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PLD5Q8N7P1 536 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 APOL6Q9BWW8 343 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FETUBQ9UGM5 382 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.06■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 APOL1O14791 398 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 HCRTO43612 131 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GABBR2O75899 941 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SETSIPP0DME0 302 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KRT4P19013 534 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 IL4RP24394 825 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DNAJC3Q13217 504 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC1A5Q15758 541 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ZBTB6Q15916 424 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CA9Q16790 459 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 NOTUMQ6P988 496 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SPOCK2Q92563 424 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SYT17Q9BSW7 474 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TYROBPO43914 113 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ELK3P41970 407 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KCNJ11Q14654 390 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms