RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2B6P20813 491 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A2P50443 739 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 WWOXQ9NZC7 414 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO21O94952 628 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 BTKQ06187 659 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF333Q96JL9 665 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 UBOX5O94941 541 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RASA2Q15283 850 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL9Q8TC94 416 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RBP1P09455 135 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB5P36952 375 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 NFIAQ12857 509 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD8Q96I13 439 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 VPS26AO75436 327 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SLC11A2P49281 568 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CNBD2Q96M20 576 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT9Q9Y305 439 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC159P0C7I6 412 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RIPK2O43353 540 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 HES6Q96HZ4 224 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD13C9JR72 458 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TPST1O60507 370 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CPA3P15088 417 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PALMDQ9NP74 551 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PEX5P50542 639 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RNF112Q9ULX5 631 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GNASQ5JWF2 1037 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF786Q8N393 782 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 HACL1Q9UJ83 578 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 NCAM2O15394 837 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 STAG3L1P0CL83 205 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 IRF1P10914 325 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RGS2P41220 211 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNB3Q05901 458 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT5Q09328 741 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CHST12Q9NRB3 414 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 V9GYQ6 96 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K6O95382 1288 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC3P17980 439 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH1A3P47895 512 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB1P30740 379 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN3P51790 818 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CCL15Q16663 113 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TLR10Q9BXR5 811 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DCLK3Q9C098 648 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MYL6P60660 151 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ORC1Q13415 861 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT8Q92599 483 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms